En database-installasjon skal spille på lag med maskinvaren og applikasjonene som kjøres på databasen. Det er også viktig at det legges opp gode backup og vedlikeholdsrutiner på serveren.
Det er ofte anbefalt at det alltid kjøres på siste versjoner av Windows og Microsoft SQL server, men det kan også være grunner til at man ikke gjør dette. Det er ikke alltid at standard programvare støtter siste versjon av databasen. Har man laget programvaren selv er det som regel ikke noe problem. Selv om man kjører siste versjon av Microsoft SQL Server, kan databasene kjøres i kompatibilitetsmodus med eldre versjoner.
En SQL installasjon bør kjøres alene på en Windows Server. Annen programbare på samme installasjon kan skape konflikter og problemer med blant annet minnebruk. Det er mulig å få dette til å spille sammen, men da bør SQL-serveren begrenses i forhold til hvor mye minne den får lov til å ta.